Zajímavá studie z Japonska:
Unnatural evolutionary processes of SARS-CoV-2 variants and possibility of deliberate natural selection
Nepřirozené evoluční procesy variant SARS-CoV-2 a možnost cíleného přírodního výběru
V posledních třech letech koronavirus 2 s těžkým akutním respiračním syndromem (SARS-CoV-2) opakovaně vyvolal pandemii a vytvořil různé mutované varianty od alfa po omikron. V této studii jsme se zaměřili na objasnění evolučních procesů vedoucích ke vzniku variant SARS-CoV-2 Omicron se zaměřením na varianty Omicron s mnoha aminokyselinovými mutacemi v proteinu hrotu mezi izoláty SARS-CoV-2. Abychom určili pořadí mutací vedoucích ke vzniku variant Omicron viru SARS-CoV-2, porovnali jsme sekvence 129 izolátů Omicron BA.1-příbuzných, 141 izolátů BA.1.1-příbuzných a 122 izolátů BA.2-příbuzných a pokusili se objasnit evoluční procesy variant Omicron viru SARS-CoV-2, včetně pořadí mutací vedoucích k jejich vzniku a výskytu homologní rekombinace. Výsledkem byl závěr, že vznik části izolátů Omicron BA.1, BA.1.1 a BA.2 nebyl produktem evoluce genomu, jak je běžně pozorováno v přírodě, například hromaděním mutací a homologních rekombinací. Studie 35 rekombinantních izolátů Omicron variant BA.1 a BA.2 navíc potvrdila, že varianty Omicron byly přítomny již v roce 2020. Analýza ukázala, že varianty Omicron vznikly zcela novým mechanismem, který nelze vysvětlit dosavadními biologickými postupy, a znalost způsobu vzniku variant SARS-CoV-2 vybízí k přehodnocení pandemie SARS-CoV-2